LINE公式アカウントに残っている情報(トーク履歴・友だち)は削除されない認識であっています。elinkからBOTを削除した場合、リッチメニューや自動応答、一斉送信等、elinkで設定したすべての設定が削除されます。

しかし、下記BOT削除時に表示される注意書きにあります通り、デフォルトリッチメニューは手動で削除してください。

※デフォルトリッチメニューを手動で削除しない場合、BOT削除後にLINEマネージャーで新しく設定したリッチメニューが反映されません。弊社では対応しかねますので、必ずご自身で削除を行ってください。